Masarykovy debaty jsou jedním z největších projektů Studentské sekce IIPS. Jedná se o veřejně přístupnou moderovanou debatu na aktuální společenské téma. Debata má tzv. Oxfordský formát, kdy proti sobě stojí dva týmy – každý o dvou řečnících – a snaží se diváky přesvědčit o platnosti nebo neplatnosti dané teze. Každý z řečníků má nejprve sedm minut na úvodní slovo, poté následuje pětadvacet minut debaty řečníků mezi sebou a dalších pětadvacet minut je věnováno divákům a jejich dotazům. Na konci debaty má každý řečník tři minuty pro shrnující závěrečný proslov. Před debatou diváci hlasují, zda s danou tezí souhlasí, neví nebo nesouhlasí. Stejné hlasování probíhá i po debatě. Vyhrává ta strana, u které je největší procentuální rozdíl oproti prvnímu hlasování.

Vždy se snažíme pozvat hosty z odlišného prostředí, aby byla debata co nejpestřejší. Naším cílem je kultivovat a podporovat veřejnou debatu a rozvíjet kritické myšlení. Každá debata má jasně danou tezi, neznamená to však, že by se s touto tezí Studentská sekce ztotožňovala. Debaty probíhají na půdě Fakulty sociálních studií, v univerzitním kině Scala nebo v Sále Břetislava Bakaly.